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单细胞转录组测序(SMART)
10x 单细胞组学
服务简介
细胞异质性是肿瘤研究和诊断治疗中亟待解决的关键问题,为了解决这一问题,单细胞测序(single cell sequencing,SCS)技术应运而生。单细胞测序技术,是在单个细胞水平上,对基因组、转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为现实。
10x Genomics单细胞转录组测序平台利用微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获技术,能够10min内自动完成多至80,000个细胞的捕获,细胞捕获率最高65%,从而获得每个细胞的3’端的转录组信息。具有细胞通量高、建库成本低、捕获周期短等优势。该技术主要用于细胞分型和标记因子的鉴定,从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测,此外该技术还可以预测细胞分化与研究发育轨迹,在当下疾病、免疫、肿瘤领域以及组织、器官、发育研究中发挥越来越重要的作用。
技术路线
基于10x Genomics 平台使用微流控技术分选单个细胞,然后将带有barcode和引物的凝胶珠以及单个细胞包裹在油滴中;在油滴中凝胶珠溶解释放反转录oligo,细胞裂解释放mRNA,通过SMART法获得用于测序的带barcode的cDNA;液体油层破坏后,cDNA进行后续文库构建,使用Illumina测序平台检测,即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据。
应用领域
肿瘤生物学:肿瘤细胞异质性、肿瘤微环境、免疫肿瘤学、癌症治疗
细胞免疫学:构建免疫图谱、免疫细胞分化、免疫缺陷i疾病研究
发育生物学:脑发育研究、胚胎发育倾向、基因表达时序性研究
神经生物学:神经细胞发育过程、不同区域神经细胞功能、神经类疾病研究
干细胞研究:干细胞分类、干细胞分化研究
植物学:植物细胞类型异质性、植物细胞分化轨迹
服务内容
单细胞转录组
单细胞 ATAC
单细胞表面蛋白检测
单细胞转录组+V(D)J 免疫组联合分析
单细胞 ATAC+mRNA 联合分析
单细胞表面抗原特异性检测
仪器设备
10x Genomics Chromium X Series
单细胞 ATAC 分析数据展示
广科安德可提供单细胞/空间组、基因组、表观组、微生物组、蛋白质组等多组学测序和生物信息学分析服务,从基础研究、转化研究到临床应用提供全方位科研技术服务及解决方案欢迎免费咨询,了解更多详细信息!我们的技术专员可免费为您提供业务评估。
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