全转录组(lncRNA+smallRNA)
项目结果速览
1、测序数据统计:longRNA-seq样本 24 个,共获得401.19 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到 15.31 Gb以上,Q30碱基百分比在94.15% 及以上。
smallRNA-seq样本 24 个,共获得312.48 M Raw Reads,各样品Raw Reads均达到 10.05 M以上,Q30碱基百分比在96.37% 及以上。
2、与参考基因组比对: 参考物种:Homo_sapiens,参考基因组版本: GRCh38.p13
longRNA-seq文库的各样本,分别与指定的参考基因组进行序列比对,比对效率从 97.01% 到 98.43% 不等。
smallRNA-seq文库的各样本,分别与指定的参考基因组进行序列比对,比对 reads 数从 7783664 到 27689014 不等。
3、表达量分析:本次共检测到各类表达的基因/转录本,具体如下:

4、表达量差异分析: 基于表达量定量结果,进行组间差异分析,具体如下:

5、靶基因预测:针对差异表达的ncRNA进行靶基因预测。
miRNA 靶基因预测结果表见下:

lncRNA 靶基因预测结果表见下:
