宏病毒组（病毒宏基因组）
分析流程主要步骤
1. 数据质控：测序得到的原始数据（Raw Data）会存在一定比例的低质量数据，为了保证后续信息分析结果的准确可靠，首先要对原始数据进行质控及宿主过滤，得到有效数据（Clean Data）；
2. 宏基因组组装：从各样品质控后的Clean Data出发，进行宏基因组组装（Metagenomic Assembly）；
3. 基因预测及丰度分析：从单样本宏基因组组装得到的contigs出发，预测contigs中的基因序列；针对所有样本得到的基因进行去冗余，得到去冗余基因；最后对去冗余基因进行定量；
4. 物种注释：从非冗余基因出发，获得每个基因的物种注释信息，并结合基因丰度表，获得不同分类层级的物种丰度表；
5. 常用功能数据库注释：从非冗余基因出发，进行KEGG，CAZy和COG数据库的功能注释和丰度分析；
6. 抗性基因注释：使用抗生素抗性基因数据库对非冗余基因进行注释，统计抗性基因丰度分布情况；
7. 基于注释结果的分析：基于物种，功能和抗性基因丰度表，可以进行丰度聚类分析和降维分析；针对样本分组，可以进行Anosim和LEfSe多元统计分析挖掘样本分组之间的差异。
